1961 yılında Emirdağ’ın Ağılcık Köyü'nde öğretmen Ahmet Harmancı ile Hüsniye Harmancı’nın üç çocuğunun ikincisi olarak dünyaya geldi. İlkokulu Eskişehir Hamidiye ilkokulunda, ortaokulu Eskişehir Süleyman Çakır Kız Lisesi'nde bitirdi. Lise öğrencisi iken AFS (American Field Service) bursunu kazanarak Amerika Birleşik Devletleri, Pittsburgh şehrine gitti ve liseyi burada (Greater Latrobe High School) tamamladı. Amerika’da eğitiminin yanı sıra liselerde Türkiye’nin tanıtılması ile konuşmalar yaptı. Amerika dönüşünde 1979 yılında üniversite sınavında Anadolu Üniversitesi Eskişehir Tıp Fakültesi'ni kazanarak 1985 yılında fakülteden ikincilik derecesi ile mezun oldu. 1985-1987 yılları arasında Çorum Devlet Hastanesi'nde zorunlu hizmetini yaptı. Zorunlu hizmet sonrasında 1987-1991 yılları arasında Eskişehir Tıp Fakültesi'nde iç hastalıkları ana bilim dalında asistanlık eğitimi yaparak iç hastalıkları uzmanı oldu. Takiben aynı yerde akademik kariyere devam ederek, önce öğretim görevlisi ve arkasından yardımcı doçentliğe atandı. İç hastalıkları uzmanlığından sonra gastroenteroloji üst ihtisasına başlayarak 1996 yılında gastroenteroloji uzmanı oldu. 2001 yılında doçent, 2007 yılında da profesör oldu.
Halen Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde İç Hastalıkları-Gastroenteroloji Ana Bilim Dalında öğretim üyeliğine devam etmekte olup, mesleğiyle ilgili yayınlanan eser ve makaleleri bulunmaktadır.
2005-2012 yılları arasında Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Gastroenteroloji Bilim Dalı Başkanlığı'nı yürütmüş olup, 2007-2011 yılları arsında iki kez Eskişehir Bilecik Tabip Odası Onur Kurulu Üyeliğine seçilmiştir. 2010-2012 yılları arasında Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi öğretim üyeleri tarafından fakülte kurulu üyeliği ve fakülte yönetim kurulu üyeliğine seçilmiştir.
Prof. Dr. Ayşegül Harmancı Özakyol Türk Tabipler Birliği, Türk Gastroenteroloji Derneği, Türk Karaciğer Araştırmaları Derneği ve Viral Hepatitle Savaşım Derneği üyesidir.
Dr. Harmancı Özakyol iyi derecede İngilizce bilmekte olup evli ve bir kız çocuk annesidir.